Trong một số trường hợp khi chúng ta làm việc với Netbeans sau một thời gian thì thường xuất hiện các vấn đề như:
- chậm,
- không hiện gợi ý,
- không design được giao diện trong SWING
- Bản cài đặt thường ở trong thư mục Program Files và
- Profile chứa các thông tin cấu hình ở trong thư mục: C:Userstên đăng nhập .netbeans.